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Plataformas tecnológicas y "big data" aplicados a la medicina de precisión

Información General

Programa curso

programa definitivo

Becarios

Listado resolución becas

Matrícula

Procedimiento de solicitud de Matricula on-line
Código
62YH
Horas
30
Fecha
01 Ago 2016
05 Ago 2016
Precio
130 € Tarifa A
Tipo
Seminario
Temática
Medicina y Ciencias de la Salud
ECTS
1

Sede donde se gestiona

Santander

Lugar de impartición

Santander - Península de la Magdalena (Salón de Baile)

Dirección

Fernando Corrales
Centro de Investigación Médica Aplicada

Concha Gil
Universidad Complutense de Madrid

PATROCINIO


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PATROCINIO


PATROCINIO

Descripción de la actividad

El desarrollo y avance eficiente de la investigación biomédica en el siglo XXI depende en gran medida de la disponibilidad de acceso por parte de los grupos de investigación a costosas tecnologías ómicas y bioinformáticas, así como al acceso rápido a grandes números de muestras biológicas de calidad y/o a la información generada sobre las mismas. El gobierno español, ha apostado por la dotación del sistema nacional de I+D+i con plataformas tecnológicas únicas, pioneras en su área, tanto por su tecnología puntera como por su liderazgo a nivel nacional e internacional. La red de Recursos Biomoleculares y Bioinformáticos, PRB2-ISCIII, incluye 5 plataformas: Plataforma en Red de Proteómica (ProteoRed), Centro Nacional de Genotipado (CeGen), Instituto Nacional de Bioinformática (INB) y Banco Nacional de ADN (BNADN) y Banco Nacional de Líneas Celulares (BNLC).

El curso propuesto está dirigido a estudiantes pre-doctorales y postdoctorales que quieran desarrollar proyectos de biomedicina donde se requieran tecnologías “ómicas” y bioinformáticas. También será de gran utilidad para el personal que esté desarrollando su formación es hospitales (MIR, FIR, QIR, etc.) y para los estudiantes de grado relacionados con la Biomedicina.

Información de las Plataformas

ProteoRed nació con el propósito de proveer a la comunidad investigadora de servicios de proteómica de alta calidad y, al mismo tiempo, desarrollar nuevas aplicaciones metodológicas. ProteoRed, además, ha desarrollado un papel de liderazgo en el desarrollo e implementación de estándares internacionales para representar, intercambiar y diseminar datos proteómicos, contribuyendo así a un proceso de colaboración científica más rápido y transparente. Asimismo, ha desarrollado actividades de formación e investigación que le han permitido establecer sinergias e interacciones con otros organismos y consorcios nacionales (tanto la Sociedad Española de Proteómica, como redes del ISCIII, entre otros) e internacionales (European Proteomics Association, EuPA, Human Proteome Organizacion, HUPO, Association of Biomolecular Resource Facilities, ABRF, etc.). En el ámbito internacional, cabe destacar que ProteoRed coordina la participación española en uno de los proyectos cooperativos de investigación científica más relevantes en el ámbito de las tecnologías ómicas, el Proyecto Proteoma Humano (HPP, Human Proteome Project).

Por su parte, CeGen, proporciona conocimiento e infraestructura a proyectos de investigación nacionales e internacionales, permitiendo ganar competitividad en la generación y transferencia de conocimiento en el campo de la genética. Su programa de trabajo se basa en facilitar servicios de genotipado que impulsen la I+D, potenciar la transmisión al mercado del conocimiento genético generado, formar a los investigadores en las últimas tecnologías de genotipado y asesorarles indicándoles las plataformas que mejor se adaptan a sus proyectos y proporcionándoles soporte en el diseño y desarrollo de los mismos. Actualmente, CeGen participa en proyectos de investigación nacionales e internacionales a través de los cuales ha establecido alianzas corporativas con CIBER, RETICS y consorcios como COGS (Collaborative Oncological Gene-environment Study) o el International Rare Disease Research Consortium (IRDiRC-RD Connect). Se hace también especial hincapié en la calidad, trabajando en la identificación de indicadores y parámetros que posteriormente implementa en su actividad diaria.

En cuanto al INB, fue fundado con la misión de proveer a la comunidad científica nacional e internacional con recursos bioinformáticos de primer nivel en áreas claves como genómica funcional, biología estructural, biología de redes y sistemas o extracción de información biomédica. Durante estos años, el INB ha desarrollado una extensa plataforma de servicios Web que integra una amplia gama de métodos bioinformáticos, muchos de los cuales han sido ampliamente utilizados -y citados- por un buen número de artículos en revistas indexadas (iHOP, Babelomics, Firestar, etc.). Desde su fundación, ha contribuido de forma sustancial en numerosos proyectos nacionales e

internacionales, desarrollando metodologías y herramientas y realizando análisis de los datos generados. El INB ha desarrollado también una intensa actividad de formación, organizando cursos y roadshows en diferentes hospitales del SNS y participando en los distintos másteres en Bioinformática, en colaboración con varias universidades. EL INB es además el nodo español en la infraestructura europea ELIXIR, la cual integra los grupos y recursos bioinformáticos más relevantes a escala europea.

Por último, forman parte de la Plataforma de Recursos Biomoleculares y Bioinformáticos (PRB2) dos biobancos que facilitan a los investigadores el acceso a muestras de calidad. El Banco Nacional de ADN (BNADN) se ha convertido desde su creación en referente nacional e internacional en el campo de los biobancos, tanto en lo relativo a los procedimientos técnicos y de innovación relacionados con la extracción, almacenamiento y gestión de muestras biológicas, como en la salvaguardia de los condicionantes éticos y el cumplimiento de los requisitos legales derivados del uso de muestras biológicas. Distribución de muestras de una calidad única, desarrollo de innovación e investigación tecnológica son los sellos que han caracterizado la andadura del BNADN desde su creación. Así, el BNADN ha registrado desde 2007 5 patentes en Europa, EEUU y Japón, todas ellas licenciadas, a la vez que ha distribuido más de 50.000 muestras en los últimos tres años para proyectos nacionales y de consorcios internacionales en los que participa de forma activa (Proyecto 1000 Genomas, International Cancer Genome Project o RD-Connect). Por último el Banco Nacional de Líneas Celulares (BNLC) está preparado para desarrollar todas las actividades relacionadas con la producción y desarrollo de líneas celulares pluripotentes, desarrollando un conjunto de tareas que permitan su utilización racional y transparente. El BNLC pretende facilitar la relación con los investigadores que trabajan con células pluripotentes, desarrollando estrategias que favorezcan el uso por parte de los investigadores de estas líneas. Entre sus objetivos, además de la prestación de servicios mediante el suministro de las líneas existentes en su catálogo, se plantea ofrecer el servicio de caracterización de nuevas líneas celulares, contribuir a la formación de sus técnicos, investigadores y estudiantes interesados o relacionados con esta temática, realizar un esfuerzo de difusión para llegar a los investigadores y a la sociedad, y promover el contacto de esta plataforma con otras plataformas, asociaciones de pacientes o donantes, consorcios de investigadores y biobancos internacionales.

Participantes

DIRECCIÓN

Fernando Corrales
Centro de Investigación Médica Aplicada

Concha Gil
Universidad Complutense de Madrid

PARTICIPANTES

Joaquín Abián Moñux
Instituto de Investigaciones Biomédicas de Barcelona

Begoña Arán Corbella
Centro de Medicina Regenerativa de Barcelona

Javier Arias Díaz
Universidad Complutense de Madrid

Javier Benítez
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas

Francisco Blanco
Instituto de Investigaciones Biomédicas de A Coruña

Joaquín Dopazo
Centro de Investigación Príncipe Felipe

Sergio Manuel Encarnación Guevara
Centro de Ciencias Genómicas de la UNAM

Andrés C. García Montero
Universidad de Salamanca

Laura Gómez Cabañas
Biobanco del Sistema Sanitario Público de Andalucía

Ana Isabel González Neira
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas

Javier Lago
SCIEX

Dunja Lukovic
Centro Andaluz de Biología Molecular y Medicina Regenerativa

Francisco Márquez
Bruker

Alberto Orfao
Universidad de Salamanca

Inés Quintela
Universidad de Santiago de Compostela

Anabel Sáez
Biobanco del Sistema Sanitario Público de Andalucía

Ferrán Sanz
Instituto de Investigación del Hospital del Mar

María Torres
Universidad de Santiago de Compostela

César Trigueros Fernández
Banco Nacional de Líneas Celulares

Alfonso Valencia
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas

Marc Via
Universidad de Barcelona

Programa

Lunes, 1 Agosto 2016

09:00
Inauguración
Concha Gil
Fernando Corrales
09:30
Implicaciones éticas del manejo de muestras biológicas en investigación.
Derechos del sujeto fuente
Andrés C. García Montero
10:30
Requisitos legales para la utilización de muestras biológicas en investigación
Javier Arias Díaz
12:00
Los biobancos como herramienta clave en la investigación biomédica traslacional
Alberto Orfao
13:00
Control de calidad: Puntos críticos en la gestión de muestras biológicas
Andrés C. García Montero
15:30
Proyecto internacional 1000 genomas
Marc Via
16:00
Mesa redonda
Proyecto internacional 1000 genomas
Marc Via
Alberto Orfao
Ana Isabel González Neira
Moderación: Andrés C. García Montero

Martes, 2 Agosto 2016

09:30
Tecnologías y diseño de proyectos de genotipado
María Torres
10:30
Estudios de asociación: del gen al genoma completo
Ana Isabel González Neira
12:00
Aplicación de los paneles de genotipado al diagnóstico de los trastornos del neurodesarrollo
Inés Quintela
13:00
Las variantes raras: significado y estrategias para su correcta valoración
Javier Benítez
15:30
ENCODE y otros proyectos de genómica masiva
Alfonso Valencia
16:00
Mesa redonda
Qué esperamos de los grandes proyectos internacionales
Alfonso Valencia
Ana Isabel González Neira
Inés Quintela
María Torres
Moderación: Javier Benítez

Miércoles, 3 Agosto 2016

09:30
Introducción. Bioinformática en los proyectos de genómica. El INB y ELIXIR
Alfonso Valencia
10:30
Análisis de genomas, RNAseq y otras omicas
Joaquín Dopazo
12:00
Análisis de relaciones entre enfermedades y genes
Ferrán Sanz
15:30
Mesa redonda
Bioinformática en la medicina de precisión y las necesidades de formación en bioinformática y biología computacional
Joaquín Dopazo
Ferrán Sanz
Moderación: Alfonso Valencia

Jueves, 4 Agosto 2016

09:30
Banco Nacional de Líneas Celulares: Estructura y Actividades
Laura Gómez Cabañas
10:30
Células madre pluripotentes. Fundamentos y tipos
Dunja Lukovic
12:00
Investigación traslacional con células madre pluripotentes
Begoña Arán Corbella
César Trigueros Fernández
13:00
Mesa redonda
El biobanco como puente entre los donantes de muestras y los investigadores
Laura Gómez Cabañas
Dunja Lukovic
Begoña Arán Corbella
Moderación: Anabel Sáez
15:30
Introducción a la proteómica
Concha Gil
16:30
Espectrometría de masas
Joaquín Abián Moñux

Viernes, 5 Agosto 2016

09:30
El proyecto proteoma humano
Fernando Corrales
10:30
Proteómica en enfermedades reumatoides
Francisco Blanco
11:45
Cáncer cervical
Sergio Manuel Encarnación Guevara
12:45
Mesa redonda
Aplicaciones de la proteómica en la clínica
Francisco Márquez
Javier Lago
Concha Gil
Francisco Blanco
Moderación: Fernando Corrales
13:45
Clausura